Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms