Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms