Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp3P59055 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms