Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rhbdl3P58873 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhbdl3P58873 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms