Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms