Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms