Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ephb3P54754 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms