Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cux1P53564 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cux1P53564 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cux1P53564 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cux1P53564 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms