Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms