Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms