Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LmnaP48678 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LmnaP48678 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LmnaP48678 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms