Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rfx2P48379 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms