Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl13P47963 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms