Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx2P43241 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdx2P43241 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms