Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms