Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6fP35460 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms