Protein–RNA interactions for Protein: P35283

Rab12, Ras-related protein Rab-12, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab12P35283 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab12P35283 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms