Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms