Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms