Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc11P31313 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms