Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Etv4P28322 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms