Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CebpbP28033 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CebpbP28033 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CebpbP28033 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CebpbP28033 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms