Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vav1P27870 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms