Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl3P27659 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms