Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CftrP26361 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CftrP26361 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CftrP26361 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CftrP26361 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CftrP26361 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CftrP26361 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CftrP26361 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CftrP26361 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CftrP26361 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CftrP26361 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CftrP26361 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CftrP26361 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CftrP26361 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CftrP26361 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CftrP26361 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CftrP26361 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CftrP26361 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CftrP26361 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CftrP26361 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CftrP26361 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CftrP26361 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CftrP26361 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CftrP26361 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CftrP26361 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CftrP26361 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CftrP26361 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CftrP26361 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CftrP26361 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CftrP26361 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CftrP26361 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CftrP26361 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CftrP26361 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CftrP26361 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CftrP26361 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CftrP26361 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CftrP26361 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CftrP26361 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CftrP26361 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CftrP26361 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CftrP26361 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CftrP26361 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CftrP26361 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CftrP26361 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CftrP26361 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms