Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms