Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms