Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NefhP19246 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NefhP19246 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NefhP19246 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NefhP19246 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NefhP19246 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
NefhP19246 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NefhP19246 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NefhP19246 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NefhP19246 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NefhP19246 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NefhP19246 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NefhP19246 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NefhP19246 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms