Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RargP18911 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RargP18911 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RargP18911 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RargP18911 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RargP18911 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RargP18911 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RargP18911 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RargP18911 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms