Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18533 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18533 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18533 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18533 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18533 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18533 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18533 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18533 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18533 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18533 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms