Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30aP15533 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms