Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SptbP15508 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SptbP15508 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SptbP15508 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SptbP15508 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SptbP15508 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SptbP15508 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SptbP15508 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SptbP15508 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SptbP15508 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms