Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myf6P15375 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms