Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dnmt1P13864 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms