Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms