Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr4a1P12813 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms