Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Timp1P12032 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms