Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MdkP12025 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MdkP12025 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MdkP12025 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MdkP12025 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MdkP12025 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms