Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp1P11438 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp1P11438 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms