Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CatspereP0DP43 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms