Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Amd1P0DMN7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms