Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd3P09027 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd3P09027 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd3P09027 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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