Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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