Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9P06683 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9P06683 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9P06683 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9P06683 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9P06683 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms