Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms