Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms