Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms