Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01734 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01734 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01734 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01734 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01734 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01734 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01734 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01734 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01734 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01734 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01734 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01734 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01734 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01734 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01734 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01734 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01734 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01734 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01734 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01734 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms