Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01664 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01664 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01664 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01664 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01664 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01664 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01664 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms