Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms